文章目录背景哪个endpoint好1all isoform2best isoform3canonical小结背景SIFTS数据整合PDB与Uniprot数据库坐标index映射哪个endpoint好1all isoform输出不仅包含标准canonical蛋白序列的对应关系还会返回该 accession 对应的所有 UniProt 剪接异构体isoforms与结构的映射https://www.ebi.ac.uk/pdbe/api/v2/mappings/all_isoforms/7W1M2best isoform返回匹配度最高的蛋白亚型isoformhttps://www.ebi.ac.uk/pdbe/api/v2/mappings/isoforms/7W1M3canonical经典结构也就是UniProt-1默认https://www.ebi.ac.uk/pdbe/api/v2/mappings/uniprot/7W1M小结uniprot其实一般人挖掘主要考虑isoform-1所以选择经典uniprot endpoint也就够了如果要考虑全面一点就使用all_isoform然后从中过滤是否是isoform-1即可。